Мультсеріал розповідає про пригоди шістнадцятирічного Бена Теннісона, який оснащений Омнітріксом - потужним пристроєм, схожим на наручний годинник, що дає йому можливість перетворюватися на різноманітних інопланетян, кожен з яких володіє унікальними здібностями та навичками. Сюжетна лінія чергується між одинадцятирічним Беном (за оригінальним серіалом) і шістнадцятирічним Беном (через кілька місяців після подій "Бен 10: Останній прибулець"). Коли Гвен їде до коледжу, а Кевін переїжджає, щоб бути ближче до неї, Бен знаходить собі нового напарника - недосвідченого водопровідника-прибульця на ім'я Рук Блонко. Разом вони вирушають досліджувати загадковий підземний інопланетний мегаполіс під назвою Андертаун, розкриваючи дивацтва інопланетного підземного світу та стикаючись з ворогами з минулого Бена, які прагнуть реваншу.