Сілі Бут (Девід Бореаназ) і Темперанс Бреннан (Емілі Дешанель) залишили свої посади в інституті Джефферсона і на службі у ФБР. Лікарка народила другу дитину, спеціальний агент тренує нових рекрутів. Співробітники Джефферсона знаходять тіло, спалене в машині, і навіть упізнають у ньому Бута, Бреннан спростовує цей факт, але агент кудись зник. Джеймс Обрі (Джон Бойд) і Грейс Міллер (Кім Рейвер) займаються його пошуками.