Події розгортаються в 1914 році. Молодий учений, Майло Тетч, - людина захоплена, і його пристрасть - це Атлантида, легендарний континент, що, якщо вірити старовинним казкам, пішов під воду, згубивши високорозвинутий народ, який там проживав. Про це йому розповів дідусь Таддеус.
Але колеги-науковці не схвалюють подібні теорії, відмовляють у фінансуванні псевдонаукових експедицій, тож доводиться понуро наглядати за бойлером у музеї Вашингтона.
На допомогу відгукується Престон Вілмор, дідусевий старий товариш. Він не лише виділяє гроші на поїздку, а й кличе юнака приєднатися, бо їм потрібен лінгвіст. Також у команді лікар Джошуа Міляга, механік Одрі Рамірес, піротехнік Вінченцо Санторіні, кухар Джебедая Фарнсворт (якого прозвали Кекс), зв'язківець Вільгельміна Пекард і геолог Гаетан Мольєр на прізвисько Кріт. Керують виїздом капітан Лайл Тіберій Рурк і лейтенант Хельга Сінклер. Вони вантажаться в гігантську парову субмарину і вирушають у дорогу.
Майже відразу ж у них виникають неприємності: Левіафан, велетенський морський монстр, руйнує підводний човен, і на невеликих міні-човнах експедитори змушені втікати в бік грота. Там вони озброюються щоденником і починають пошуки, а в підсумку виходять до старовинного міста.
Виявляється, атланти насправді живі і весь цей час за ними стежили. Їхній король швидко розуміє, що насправді хочуть прибульці, тож дозволяє їм гостювати лише один день.
Майло заводить дружбу з королівською донькою Кідою, і вона проводить йому екскурсію, а заразом розповідає, що їхній народ багато чого забув, і навіть тексти прочитати не здатний, а через це і до літальних апаратів у них доступу немає. Лінгвіст-науковець усе пояснює, заодно допомагає розібратися, що насправді являє собою енергетичний кристал.
Тим часом на це джерело енергії поклав око Рурк. Він захоплює Тетча і його подружку в полон, займає палац і вбиває алтанта-короля. Здобич же він має намір вигідно продати кайзеру, та Кіду теж із собою відвозить, бо вона тісно пов'язана з артефактом.
Без кристала країна занурюється в темряву. Перед смертю монарх благає все повернути.
Вирішено атакувати злодія в жерлі згаслого вулкана. Зав'язується неабияка битва, і найманці вмирають. Але прокидається вулкан, і ті, хто залишився в живих, ледве встигають забрати кристал, перш ніж повернутися.
Майло залишається з Кідою відновлювати державу. Решта ж із цінними дарами повертаються в Америку.