Від самого народження Балто вважався аутсайдером, якого інші тварини відмовлялися приймати до свого кола. Будучи наполовину псом, а наполовину вовком, головний герой відчував себе моторошно самотнім. Навколишні пси тільки й робили, що насміхалися, та всіляко знущалися над бідолахою, щоразу відпускаючи черговий єхидний жарт на його адресу. Навіть безжальні люди прагнули зайвий раз щосили штовхнути ногою нещасного напівкровку. Єдиними створіннями, які завжди підтримували "недопса", були гусак на прізвисько Борис, який емігрував із далекої росії, два кумедних ведмедика Мак і Лак, а також чарівна сибірська лайка Дженна, що мала чудове червоне забарвлення.
Найближчі друзі чітко з'ясували, що всередині у місцевого вигнанця б'ється справжнє благородне серце, а сам він - найдобріша і чуйна істота. Коли ж у невеликому містечку на Алясці, де народився і нині мешкає Балто, зафіксували спалах найнебезпечнішої епідемії, наш сміливець, нарешті, отримає заповітний шанс продемонструвати свої лідерські якості. Саме він постарається, пройшовши крізь безліч неприємностей, воюючи з ведмедями і озлобленими вовками, перетнути півкраїни, щоб вчасно доставити ліки.