Історія розповідає про головного героя, капітана Апача (у виконанні Лі Ван Кліфа), корінного американського правоохоронця, який розслідує вбивство індіанського агента. Заглиблюючись у справу, капітан Апач стикається з павутиною корупції, обману та змови, в якій задіяні різні персонажі, зокрема інтриган-полковник (Стюарт Вітмен) та загадкова жінка (Керрол Бейкер). Фільм поєднує в собі елементи традиційного вестерну з відтінком таємничості та сатири, оскільки капітан Апач мандрує складним сюжетом, сповненим поворотів і несподіванок. "Капітан Апач" відомий своїм нетрадиційним поглядом на жанр вестерну, поєднанням екшену та інтриги.