У центрі сюжету - життя двох старшокласниць Морітані Місузу та Муракамі Харуки. Місузу володіє унікальною здатністю зупиняти час на три хвилини щодня. Вона використовує цю здатність, щоб спостерігати і досліджувати навколишній світ, поки всі інші залишаються нерухомими. Однак у цей час вона не може взаємодіяти з людьми. Одного дня Місузу помічає, що на Харуку, її однокласницю, її здатність зупиняти час не впливає. Здивована і заінтригована, вона підходить до Харуки і виявляє, що вона може вільно пересуватися в зупиненому часі так само, як і вона. Вони обидві діляться секретом своїх здібностей і вирішують провести свій "фрагтайм" разом.
Чим більше часу Місузу і Харука проводять разом, тим більше між ними розвивається глибокий зв'язок і дружба. Місузу, яка завжди відчувала себе ізольованою та віддаленою від інших, знаходить розраду в компанії Харуки. Разом вони досліджують свою школу, вирушають у маленькі пригоди і поступово відкриваються одна одній у своїх особистих проблемах і бажаннях.