Едвард Елрік опиняється в пастці в паралельному світі Землі, а саме в 1920-х роках у Мюнхені, Німеччина. Розлучений зі своїм братом Альфонсом, Едвард сповнений рішучості знайти спосіб повернутися у свій власний світ. У Мюнхені Едвард знайомиться з режисером Альфонсом Гейдеріхом і дізнається про піднесення нацистської партії та загрозу Другої світової війни, що насувається. Тим часом він дізнається, що таємна організація "Товариство Туле" намагається відкрити портал у світ Едварда за допомогою алхімії. Лідерка товариства Дітлінда Екхарт вірить, що підкорення міфічного міста Шамбала дасть їй безмежну владу.
Шлях Едварда переплітається з планами Товариства Туле, оскільки він прагне перешкодити їм відкрити ворота і захистити обидва світи від знищення. По дорозі він зустрічає знайомі обличчя зі свого минулого, включаючи друзів і ворогів.