Ніндзяго: День мертвих - це свято, яке відбувається у вигаданому світі Ніндзяго, де ніндзя вшановують і згадують тих, хто відійшов у вічність. Це свято займає особливе місце в серцях ніндзя, адже кожен з них втратив близьких під час своїх пригод. У цей день кожен ніндзя знаходить час, щоб відвідати місця, де пам'ятають їхніх близьких. Джей відвідує могилу своїх батьків на звалищі, Ллойд і Місако йдуть до Коридору Старійшин, щоб віддати шану Харумі, Зейн знаходить хвилину, щоб згадати свого батька в Березовому лісі, а Кай і Нія згадують своїх батьків разом.
Тим часом Коул намагається змиритися з власним існуванням як привид. Незважаючи на те, що він є членом команди ніндзя, Коул відчуває себе відірваним від живого світу і не може взаємодіяти з ним так само, як його товариші по команді. Він відвідує сенсея Яна, сподіваючись знайти відповіді на свої питання про свою ідентичність і місце у світі.