Події розгортаються навколо Джейсона Борна, чоловіка, якого рибальський човен знаходить непритомним з кульовими пораненнями в Середземному морі. Він страждає на амнезію і не пам'ятає ні свого минулого, ні своєї особистості. Прокинувшись, Джейсон Борн виявляє, що володіє винятковими бойовими здібностями та навичками виживання, але не пам'ятає, як він їх набув. Єдиний ключ до його особистості - мікрочіп, імплантований у стегно, з номером рахунку в швейцарському банку. З допомогою молодої жінки на ім'я Марі Борн вирушає в подорож, щоб розгадати таємницю своєї справжньої ідентичності.
Досліджуючи своє минуле, Борн розуміє, що його переслідує команда найманих вбивць, підісланих підпільною організацією "Тредстоун". Вміння та винахідливість Борна допомагають йому вислизнути від переслідувачів і відкрити фрагменти свого забутого життя. Попутно він дізнається, що колись був висококваліфікованим таємним агентом "Тредстоуна", який брав участь у небезпечних місіях і вбивствах.