Іттокі Сакураба був звичайним хлопцем, доки одного разу його життя не перевернулося догори дном! Одного разу, він дізнається, що є дев'ятнадцятим спадкоємцем відомого клану ніндзя - Іга. Їм протистоїть клан Кога, який хоче забрати життя в Іттокі. І тепер йому необхідно стати сильнішим, щоб захистити не тільки себе, а й усе своє село. Для цього він вступає до академії Кокутен, де опановує ремесло сучасних ніндзя. Разом з учнями з інших сіл Іттокі вступає в протистояння з кланом Кога, щоб раз і назавжди покінчити з цією ворожнечею.