У 6 сезоні ще більше поглиблюються стосунки між членами екіпажу і досліджуються етичні та моральні дилеми.
Капітан Пікард стикається з викликами, приймаючи командування новим зорельотом "Ентерпрайз-D".
У сезоні показано громадянську війну між клінгонами та повернення знайомих супротивників, таких як борги та ромуланці.
Такі епізоди, як "Ланцюг командування" та "Гобелен", заглиблюються в характер Пікарда та його минуле.
Серіал продовжує порушувати складні проблеми та етичні питання.