Події розгортаються у світі майбутнього, де людство воює проти потужного військово-морського флоту, відомого як "Флот туману". У цьому світі розумні військові кораблі, відомі як "Ментальні моделі", керовані штучним інтелектом, захопили морські простори і зробили традиційну морську війну застарілою. Ці військові кораблі володіють передовими технологіями та величезною вогневою міццю, що робить їх майже непереможними.
Гунзо Чіхая, молодий капітан, який командує підводним човном I-401. Разом зі своїм екіпажем Гунзо стикається з таємничою Ментальною моделлю на ім'я Іона, яка володіє унікальною особистістю порівняно з іншими кораблями Флоту Туману. Іона вирішує дезертирувати зі свого флоту і об'єднується з Гунзо, утворюючи малоймовірне партнерство.