Події розгортаються у постапокаліптичному світі, де більша частина людства мешкає у куполоподібних містах, щоб захиститися від екологічної небезпеки. Головна героїня - Ре-Л Майєр, слідча в одному з таких куполоподібних міст під назвою Ромдо.
Їй доручено розслідувати загадкові інциденти, пов'язані з істотами, відомими як "авторейви", андроїдоподібними роботами, призначеними для служіння людям. Під час своїх розшуків Ре-Л зустрічає загадкового і беземоційного авторейва на ім'я Вінсент Лоу. Разом вони розкривають низку таємниць про природу їхнього світу та існування прихованої істини, відомої як "Проксі".