Події починаються через півроку після другого сезону. Лі почала нове життя, зустрівши нового чоловіка, а Гордон (Бен Маккензі) перетворився на мисливця за головами, переслідуючи тих, хто втік з Аркхема. Пінгвін оголошує нагороду в мільйон доларів за Фіш Муні - живу або мертву. Загадковий двійник Брюса снує Готемом і дізнається багато цікавого від Айви, яка прийняла його за справжнього Брюса.
За допомогою захопленої репортерки Валері Вейл Гордону вдається вистежити асистентку Стренджа Етел Пібоді, але першою її наздоганяє і вбиває Фіш. Фіш наказує вбити Айві, і ту торкається істота, яка прискорює процеси старіння, але Айві вдається втекти, впавши в трубу. Її викидає на берег дорослою.
Брюс (Девід Мазоуз) і Альфред скликають раду директорів Вейн Ентерпрайзіс, і Брюс ставить їм ультиматум. Брюса викрадають, і він постає перед судом, очолюваним Кетрін. Вона вимагає його кинути розслідування всередині компанії, Індійського Пагорба і смерті своїх батьків в обмін на збереження життів тих, хто до нього близький. Гордон укладає договір з Фіш, дозволяючи їй втекти зі Стренджем в обмін на Гарві, але потім він повідомляє Пінгвіну план втечі Фіш. Пінгвін готовий її вбити, але відпускає Фіш, коли вона каже йому, що залишила його в живих, тому що він був її найкращим творінням.