Події другого сезону продовжують історію першого. Локі (Том Гіддлстон) знову співпрацює з Управлінням часовими змінами та працює з Мобіусом М. Мобіусом (Оуен Вілсон), хоча той його зовсім не пам'ятає. Разом із Мобіусом Локі намагається знайти Сільвію (Софія Ді Мартіно), яка переховується в альтернативному вимірі.
З чуток, у другий сезон також повернеться Джонатан Мейджерс ("Білий хлопець Рік", "Людина-мураха і Оса: Квантоманія", "Крід 3"), який у першому сезоні зіграв роль Канга Завойовника, або "Того, хто залишається". За сюжетом першого сезону, герой Мейджерса створив Управління часовими змінами, придушив цим усі реальності та зробив так, щоб у мультивсесвіті був лише один вимір. Таким чином персонаж хотів уникнути мультивсесвітньої війни, яку могли влаштувати інші його версії. Перед тим, як бути вбитим Сільвей, Канг попередив Локі, що після його смерті альтернативні Канги захочуть завоювати всі світи. Тому не виключено, що в другому сезоні з'являться відразу кілька версій "Того, хто залишається". Ще однією причиною появи інших Кангів, можливо, стане "Ткацький верстат часу", що слугує джерелом енергії Управління тимчасовими змінами, за допомогою якого співробітники організації використовують енергію з потоку часу.