Через тридцять років після катастрофи Третьої світової війни, коли столиця Японії була знищена ядерною зброєю, Новий Токіо відроджується з попелу. Хоча зовні місто здається мирним, його влада нагадує фашистський режим, що безжально придушує будь-які повстанські рухи. У спеціальних центрах проводяться парапсихологічні дослідження, метою яких є використання людських здібностей для створення потужної зброї.
На тлі цієї напруженості полковник Шікішіма, відповідальний за дослідницьку ініціативу в галузі біологічної зброї, кидає виклик владі. Паралельно з цим зростає культ надлюдини Акіри, який пророкує, що саме він володіє ключем до майбутнього Японії та її спасіння.