Вірус заражає інтернет і починає спричиняти хаос у реальному світі. Цей вірус Дігімон, пізніше відомий як Діаборомон, швидко починає захоплювати цифрову інфраструктуру, спричиняючи дорожньо-транспортні пригоди, втручаючись у роботу фондового ринку і навіть зламуючи військові мережі, щоб запустити ядерну ракету.
DigiDestined, особливо Тай та Іззі, спочатку змушені боротися з цією новою загрозою зі свого комп'ютера, а їхні партнери Діґімони воюють у цифровому просторі інтернету. Ситуація загострюється, і їм потрібно з'ясувати, як перемогти цього ворога, що швидко еволюціонує та розмножується, перш ніж реальний світ зазнає катастрофічних наслідків.