Друга частина розповідає про майора Мотоко Кусанагі, яка продовжує розплутувати складні кіберзмови у футуристичному, технологічно розвиненому суспільстві. Успішно створивши власну незалежну групу, Кусанаґі отримує завдання розслідувати справу колишнього солдата, який захопив конвой з високим рівнем безпеки. Ця справа пов'язана зі зростаючою загрозою кібертероризму та політичним конфліктом, що насувається, за участю загадкового хакера, відомого як «Fire-Starter». Коли Кусанаґі та її команда копають глибше, вони розкривають змову, яка може дестабілізувати глобальну безпеку. Фільм досліджує теми лояльності, свободи та маніпуляції пам'яттю, поєднуючи складне кібершпигунство з гостросюжетними сценами та філософськими роздумами про ідентичність та свідомість у високо мережевому світі.