Томас та інші Глейдери втекли з Лабіринту і тепер стикаються з новим випробуванням - потрапляють на об'єкт таємничої організації WCKD, де дізнаються, що були частиною експерименту з пошуку ліків від смертельного вірусу, а WCKD має ще темніші наміри.
Томас і його друзі опиняються у Скорчі - безлюдній пустелі, де панує сильна спека і живуть інфіковані люди, відомі як "диваки". Вони зустрічають групу бійців опору на чолі з чоловіком на ім'я Хорхе та дівчиною на ім'я Бренда. Разом вони вирушають у небезпечну подорож через Скорч, стикаючись з численними перешкодами, серед яких підступні ландшафти, смертельні пастки та невблаганні диваки. Протягом своєї виснажливої подорожі група стикається зі зрадами, жертвами та шокуючими одкровеннями про своє минуле і справжню природу Лабіринту. Час спливає, а загроза WCKD наближається, і Томасу та його друзям доводиться покладатися на свою мужність і стійкість, щоб пережити Опік і розкрити таємниці, які визначать їхнє майбутнє.