Страждаючи від частих нападів астми, юна Анна Сасакі мовчазна, нетовариська та ізольована від однолітків, що викликає нескінченне занепокоєння у її прийомних батьків. За рекомендацією лікаря Анну відправляють у сільську місцевість, сподіваючись, що чисте повітря і більш спокійний спосіб життя покращать її здоров'я і допоможуть прояснити розум.
Одного разу, блукаючи вулицею, Анна натрапляє на занедбаний особняк, відомий як "Будинок на болоті". Однак незабаром вона з'ясовує, що резиденція не така вже й порожня, як здається, зіткнувшись із загадковою дівчиною на ім'я Марні. Весела поведінка Марні поступово починає витягувати Анну зі своєї мушлі, і вона повертається сюди щовечора, щоб зустрітися зі своєю новою подругою. Але, здається, дивна дівчина приховує більше, ніж здається на перший погляд - коли час її перебування в містечку добігає кінця, Анна починає відкривати для себе правду, що ховається за стінами Болотяного будинку.