Кобато, маючи гіркий досвід дедуктивної діяльності, відомої як "робота над мудрістю", був сповнений рішучості жити чесним і скромним громадянином. Він таємно об'єднався зі своїм однокласником Осанаї, який мав таку ж мету. Разом вони планували розпочати своє шкільне життя як звичайні громадяни і насолоджуватися мирними днями. Однак загадкові події та нещастя постійно порушують їхнє шкільне життя. Чи вдасться Кобато та Осанай досягти мирних, звичайних днів, яких вони так прагнуть?