4-й сезон присвячений наслідкам Тіньової війни та зусиллям з відбудови по всій галактиці.
Земний Альянс стикається з політичними потрясіннями, оскільки авторитарний режим президента Кларка вживає радикальних заходів.
Шерідан та його союзники намагаються звільнити Землю з-під контролю Кларка, що призводить до масштабного протистояння.
У сезоні досліджуються теми громадянських прав, лояльності та наслідків влади.
У ньому також відбувається розв'язка кількох давніх персонажів і сюжетних ліній.