Перший сезон "Кланад" розповідає про життя Томої Окадзакі у старшій школі та його сімейні проблеми, зокрема напружені стосунки з батьком. Він знайомиться з дівчиною на ім'я Нагіса Фурукава, яка після хвороби залишається на другий рік у старших класах. Між ними зав'язується тісна дружба, і разом з іншими друзями, яких вони зустрічають на цьому шляху, зокрема Кьо Фуджібаяші, Котомі Ічіносе та Томойо Сакаґамі, вони підтримують один одного, долаючи різні особисті труднощі. У сезоні досліджуються теми дружби, сім'ї та емоційного зростання.