У другому сезоні пригоди Геракла продовжуються, оскільки він стикається з більш широким спектром викликів, як смертних, так і божественних. У сезоні з'являється Автолік, король злодіїв, який стає постійним персонажем і другом Геракла. Геракл зустрічається з міфічними істотами, бореться з богами та досліджує свої стосунки з іншими легендарними постатями, зокрема із Зеною, яка згодом отримає власний спін-офф серіал.
Теми спокути, героїзму та наслідків власних вчинків продовжуються і в другому сезоні. Дружба Геракла з Іолаєм поглиблюється, і їхнє товариство стає центральним елементом багатьох епізодів. Сезон також заглиблюється у складні стосунки Геракла з богами, особливо з Герою, яка продовжує становити загрозу для нього і тих, хто йому дорогий.