У центрі нової історії - Рейден, Лю Кан, Джонні Кейдж, Джакс і Соня Блейд. Разом вони знову прибувають на планету Земля, де, як виявилося, вже зібралися бійці з армії Зовнішнього світу під керівництвом імператора Шао Кана.
Героям доводиться обирати: або брати участь у черговій смертельній битві, або дозволити Шао Кану захопити і знищити Землю, а слідом за нею і всі інші існуючі світи.
Пряме продовження "Легенди Мортал Комбат: Помста Скорпіона".