У дев'ятому сезоні Кларк стикається з прибуттям на Землю криптоніанців, які вижили, зокрема його кузини Кари та лиходія Зода. Він стає Пятною, таємничим героєм, який захищає Метрополіс, водночас розбираючись у своїх складних стосунках і постійній боротьбі з власною ідентичністю та долею. У сезоні з'являється персонаж Тесс Мерсер, яка стає центральною фігурою в житті Кларка.