У другому сезоні "Вояджера" екіпаж зустрічає нові цивілізації, види та виклики, а також стикається з іншими проблемами. Вони досягають значного прогресу в дослідженні Дельта-квадранта, але загроза Казона не зникає. У цьому сезоні також з'являються нові персонажі та відбувається подальший розвиток вже існуючих.