У четвертому сезоні зустрічі екіпажу в Дельта-квадранті стають дедалі різноманітнішими та складнішими. "Вояджер" стикається з інопланетними істотами, що володіють унікальними технологіями, зокрема з гірогенами та малонцями. У сезоні досліджуються теми ідентичності, етики та наслідків їхніх вчинків на шляху додому.