Міжгалактична війна Добра і Зла в самому розпалі. Дроїди-сепаратисти тіснять армії клонів. Перебуваючи в царстві мертвих, майстер Квай-Гон Джинн контактує з гранд-майстром Йодою: він повинен розкрити секрети істинної сили ситхів, відвідавши їхню стародавню батьківщину.
Страждання солдата-клона від важкого захворювання спричинять смерть майстра джедая. Безстрашний воїн і сам не зрозумів, що ж сталося. У надії напасти на слід мотивів і причин убивства, солдат, у супроводі Анакі**на, вирушає на експертизу. Однак дорогою вони стають жертвами воїнів темних сил. Незважаючи на це, Анакі**ну і солдату-клону вдається дістатися до лабораторії Каміно, де клону необхідно пройти найуважніше обстеження для того, щоб дістатися до причин і мотивів вбивства майстра. Для більш детального аналізу в лабораторії вдалося проникнути у свідомість солдата і там дослідники виявили таємний шифр до програми клонування солдатів. Але і це ще не всі відкриття. Виконуючи таємну місію, джедаї несподівано для себе знаходять світловий меч, який колись був загублений ними. Багато таємниць і загадок належить розкрити в цій війні. Хто ж стане переможцем у цій тривалій битві?