Підлітки мутанти черепашки ніндзя

Шреддер повертається з Виміру Ікс, але Кранг не вірить йому через невдачу в битві з черепашками і Сплінтером за допомогою технології Кранга. Шреддер повинен довести свою надійність, інакше він не отримає допомогу від піхотинців Кранга або Рокстеді та Бібопа, які залишилися у Вимірі Ікс.

Шреддер вирушає до корумпованої школи карате, де навчається злочинний ганг, як скоювати злочини, прикидаючись черепашками, намагаючись таким чином дискредитувати справжніх черепашок. Він також визволяє Бакстера Стокмана з-під варти і віддає йому завдання викрасти Сплінтера.