Серіал «Хороший лікар» розповідає про Шона Мерфі, який є досить обдарованим, розумним та перспективним молодим лікарем. Він хоче все своє життя присвятити хірургії, але оточуючі не сильно вірять у нього. Вся проблема полягає в тому, що хлопець страждає на аутизм, що ускладнює спілкування з людьми, близькими та рідними.
П’ятий сезон розпочинається з того, що Шон і Лея вирішують влаштувати вечірку в честь своїх заручин, та запрошуються на святкування друзів-лікарів. В цей час одній молодій матері стає відомо, що її син, можливо, заразився небезпечним захворюванням. Причому це сталося за дуже дивних обставин. Шон Мерфі збирає команду лікарів, щоб спасти немовля.