Події другого сезону розгортаються в далекому майбутньому в Небрасці, через десять років після зомбі-апокаліпсису. Сюжет зосереджується на групі молодих людей, що вижили, які виросли в апокаліпсисі. Серед них - дві сестри: Айріс (Алайя Ройял) і Хоуп Беннетти (Алекса Мансур), які живуть у стінах університетського містечка в Омасі, штат Небраска. Цю колонію створили люди, які вижили, щоб забезпечити наступним поколінням відносно нормальне і безпечне життя. За стінами колонії все ще бродять зомбі в очікуванні наступної людської помилки.
Поряд із колонією існує могутня Громадянська Республіка - таємнича організація людей, що вижили, з авторитарними засадами і високорозвиненою технологічно оснащеною армією. Не маючи іншого виходу, колонія об'єднала свої сили з Громадянською Республікою. Відомий і досвідчений учений, батько Айріс і Хоуп Леопольд (Джо Голт), на пропозицію представників Цивільної Республіки вирушає до штаб-квартири, що розташована в секретній установі в Нью-Йорку. Він згоден допомогти їхнім ученим розробити протиотруту, яка зупинить спалах зомбі.