Наприкінці 10-го сезону "Секретних матеріалів" світ охопив
невідомий смертельний вірус. Імунітет від таємничої хвороби, як виявилося, є
тільки у Дани Скаллі, і тепер доля семи мільярдів землян перебуває в руках
спецагентів. Заради порятунку людства, шоураннери проєкту ввели в сюжет нового
персонажа. Однією з головних дійових осіб у новому сезоні стане син агентів
Малдера (Девід Духовни) і Скаллі Вільям, який з'явився на світ у результаті
штучного запліднення і названий на честь батька Малдера.
11-й сезон починається з боротьби зі смертельно небезпечним Спартанським
вірусом, страшна епідемія якого охопила світ. Крім того, в нових серіях
з'являться і всі головні дійові особи, включно з Курцем і директором ФБР
Скінером у виконанні Мітча Піледжі.
За традицією всі події серіалу будуть вписані в реалії нашого світу, а на
глядача чекають нові викриття урядових змов і діяльності інопланетних
прибульців. Автори серіалу обіцяють також появу в сюжеті якихось "милих
монстрів".