Дані Скаллі (Джилліан Андерсон) не дає спокою таємниця, що огорнула її
таємниче викрадення. Вона намагається докопатися до істини, проте нагальні
справи не залишають їй вільного часу. Розслідуючи справу про спроби модифікації
людської ДНК для боротьби з віспою, вона виявляє сліди діяльності нацистського
вченого, який намагався створити гібрид людини і прибульця. Однак, втручання
ФБР у цю справу припало комусь не до смаку - цієї ж ночі була застрелена сестра
Дани - Меліса (Мелінда МакГроу). Скаллі розуміє, що вбивці просто помилилися -
справжньою метою була саме вона.
Коли Малдер (Девід Духовни) знаходить докази урядових експериментів над
прибульцями, на нього здійснюють напад. Отримавши важке поранення, Фокс на
деякий час відходить від справ.
Дана тим часом зустрічає кількох жінок, чиї історії про викрадення напрочуд
схожі на її власну. Їй вдається дізнатися, що під час викрадення над нею
ставили досліди японські вчені. Залишається лише з'ясувати, чому для дослідів
вони обрали саме її.
Наступною справою, за яку беруться спеціальні агенти, стає розслідування
причин загибелі французького підводного човна, що затонув під час Другої
світової війни. Інтерес ФБР викликає той факт, що в ракетній шахті цього
підводного човна, імовірно, захований НЛО.
