У другому сезоні Торчвуд продовжує свою місію із захисту Землі від інопланетних і надприродних небезпек. Команда стикається з новими викликами, серед яких відродження капітана Джона Гарта (Джеймс Марстерс), агента часу-ізгоя зі складною історією з капітаном Джеком. У цьому сезоні досліджуються теми кохання, втрат і наслідків безсмертя.