У другій частині аніме минуло кілька років після переїзду Хотару Ітідзьо у відокремлене японське село. Тепер їй уже 16 років, і вона стала старшокласницею, не перестаючи захоплюватися читанням книг. Однак її інтерес до книг виходить за межі простого читання, і вона почала власну творчість, пише власні романи й оповідання, мріючи опублікувати їх у майбутньому. Вона залишається близькою з друзями, яких завела в першій частині аніме, такими як Комарі, Рен і Сугу. Вони досі проводять багато часу разом, займаючись різними хобі та відкриваючи для себе нові цікаві місця в околицях села.
Одного разу Хотару знайомиться із загадковим хлопцем, який щойно переїхав до села. Він з'являється в школі й одразу ж привертає увагу всіх дівчат, включно з Хотару. Хлопець носить окуляри і завжди при собі тримає книгу. Він говорить мало, але його слова завжди розумні та цікаві. Дівчина починає цікавитися цим хлопцем і проводить із ним дедалі більше часу. Однак разом із новим знайомим приходять і нові проблеми. Однієї ночі зламали книжковий магазин, де Хотару зазвичай проводить час. Наступного ранку її новий друг виявляється головним підозрюваним у цій справі. Хотару не вірить у його провину і починає власне розслідування, щоб розгадати цю загадку.