SG-1 успішно проникає на флагманський корабель Апофіса і знищує його, залишаючи всі події оповитими таємницею. Земні дослідники продовжують досліджувати різні планети і виявляють, що серед Гоаулдів є повстанці ТокРа, які чинять опір Системним Володарям. SG-1 намагається укласти з ними союз. Тим часом серед самих Системних Лордів починається боротьба за владу, і навіть Апофіс не може втримати ситуацію під контролем.