Черепашки Мутанти Ніндзя. Нові Пригоди

Трицератони починають масоване вторгнення на Землю, помилково вважаючи, що професор Ханікатт все ще переховується на планеті. Щоб запобігти подальшому знищенню, Ханікатт повертається на Землю з наміром здатися трицератонам, зробивши самовідданий вчинок, щоб запобігти подальшому знищенню. Однак і Ханікатт, і черепахи потрапляють у полон до Сил оборони Землі на чолі з агентом Бішопом, який об'єднав сили з Федерацією.

Серед хаосу трицератоніанський дисидент Траксімус піднімає повстання і скидає імператора Занрамона. Відважно пожертвувавши собою, Ханікатт завантажує комп'ютерний вірус у флоти Трицератонії та Федерації, створюючи подальший безлад і послаблюючи їхні сили. Скориставшись нагодою, Шреддер заробляє на безладі, що виник, привласнюючи собі ім'я Ороку Сакі і використовуючи його для відбудови Нью-Йорка та посилення своєї влади.

Тим часом Сплінтер і Черепашки стикаються з "Найвищим Драко" - могутньою сутністю, що утворилася в результаті злиття ніндзя Уе-Сама і Драко. Озброєний скіпетром часу Лорда Симультануса, "Драко's Ultimate" розкидає наших героїв по різних вимірах і періодах часу. Мікеланджело опиняється у світі, де Черепахи - шановані супергерої, які борються зі своїм власним корумпованим Сплінтером. Рафаель потрапляє у всесвіт популярної франшизи "Планетарні гонщики". Донателло потрапляє в похмурий світ, де Землю завоював Шреддер. Нарешті, Леонардо переноситься у вимір Міямото Усагі, де він об'єднує зусилля з Усагі, щоб подолати різноманітні виклики. Разом вони вирушають до Бойового Нексусу, збираючи своїх розрізнених союзників, щоб перемогти грізного Досконалого Драко. Поки триває битва, Уе-Сама, звільнена, радісно возз'єднується зі своїм батьком.

Отримавши видіння про те, що Шреддер покидає Землю, щоб завоювати свою рідну планету Морн, Сплінтер об'єднує черепашок разом з їхніми союзниками Кейсі, Ейпріл, крокодилом-мутантом Шкіряною головою та вцілілим Медоносом у зухвалому штурмі твердині Шреддера. Несподівано Бішоп об'єднується зі Стокманом, щоб у тандемі протистояти спільній загрозі. Незважаючи на їхні відважні зусилля, героям не вдається завадити Шреддеру запустити свій зореліт, і вони готуються до благородної жертви, підірвавши ядро корабля, що може коштувати їм життя.

Однак, коли надія здається втраченою, вчасно з'являються доброзичливі Утроми, які рятують наших героїв і засилають Шреддера на безлюдний крижаний астероїд. День врятовано, і герої виходять переможцями завдяки вчасному втручанню Утромів.